MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicycliphilus denitrificans BC chromosome

Total Repeats: 132073

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
132001	NC_014910	TCGGG	2	10	4634497	4634506	0 %	20 %	60 %	20 %	319765065
132002	NC_014910	GCA	2	6	4634530	4634535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319765065
132003	NC_014910	AGC	2	6	4634553	4634558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319765065
132004	NC_014910	GAA	2	6	4634567	4634572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319765065
132005	NC_014910	GC	3	6	4634614	4634619	0 %	0 %	50 %	50 %	319765065
132006	NC_014910	CAG	2	6	4634639	4634644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319765065
132007	NC_014910	ATG	2	6	4634682	4634687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319765065
132008	NC_014910	GGCA	2	8	4634688	4634695	25 %	0 %	50 %	25 %	319765065
132009	NC_014910	GCC	2	6	4634696	4634701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765065
132010	NC_014910	CAT	2	6	4634735	4634740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319765065
132011	NC_014910	CTG	2	6	4634744	4634749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765065
132012	NC_014910	CTG	2	6	4634753	4634758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765065
132013	NC_014910	ACC	2	6	4634874	4634879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319765065
132014	NC_014910	CAGC	2	8	4634963	4634970	25 %	0 %	25 %	50 %	319765065
132015	NC_014910	CAG	2	6	4635011	4635016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319765065
132016	NC_014910	GC	3	6	4635044	4635049	0 %	0 %	50 %	50 %	319765065
132017	NC_014910	TGGACT	2	12	4635055	4635066	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	319765065
132018	NC_014910	CAG	2	6	4635164	4635169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319765065
132019	NC_014910	AGT	2	6	4635184	4635189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319765065
132020	NC_014910	TGG	2	6	4635214	4635219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319765065
132021	NC_014910	CTT	2	6	4635278	4635283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319765065
132022	NC_014910	GGCCG	2	10	4635299	4635308	0 %	0 %	60 %	40 %	319765065
132023	NC_014910	ACG	2	6	4635325	4635330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319765065
132024	NC_014910	TTG	2	6	4635345	4635350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319765065
132025	NC_014910	GCG	2	6	4635379	4635384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765065
132026	NC_014910	ACC	2	6	4635408	4635413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319765065
132027	NC_014910	C	6	6	4635477	4635482	0 %	0 %	0 %	100 %	319765065
132028	NC_014910	CG	3	6	4635535	4635540	0 %	0 %	50 %	50 %	319765065
132029	NC_014910	GCC	2	6	4635584	4635589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765065
132030	NC_014910	TCG	2	6	4635630	4635635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765065
132031	NC_014910	AGC	2	6	4635636	4635641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319765065
132032	NC_014910	CCG	2	6	4635705	4635710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765065
132033	NC_014910	GCA	2	6	4635730	4635735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319765065
132034	NC_014910	CG	3	6	4635760	4635765	0 %	0 %	50 %	50 %	319765065
132035	NC_014910	GCCG	2	8	4635791	4635798	0 %	0 %	50 %	50 %	319765065
132036	NC_014910	GCG	2	6	4635822	4635827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765065
132037	NC_014910	CTG	2	6	4635828	4635833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765065
132038	NC_014910	CGCC	2	8	4635853	4635860	0 %	0 %	25 %	75 %	319765065
132039	NC_014910	CCG	2	6	4635874	4635879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765065
132040	NC_014910	GC	3	6	4635880	4635885	0 %	0 %	50 %	50 %	319765065
132041	NC_014910	CGG	2	6	4635899	4635904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765065
132042	NC_014910	GAA	2	6	4635911	4635916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319765065
132043	NC_014910	TTG	2	6	4635924	4635929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319765065
132044	NC_014910	GCG	2	6	4635998	4636003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765065
132045	NC_014910	CG	3	6	4636080	4636085	0 %	0 %	50 %	50 %	319765066
132046	NC_014910	GCT	2	6	4636089	4636094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765066
132047	NC_014910	CCCT	2	8	4636111	4636118	0 %	25 %	0 %	75 %	319765066
132048	NC_014910	GC	3	6	4636135	4636140	0 %	0 %	50 %	50 %	319765066
132049	NC_014910	CGG	2	6	4636170	4636175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765066
132050	NC_014910	AGC	3	9	4636256	4636264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319765066
132051	NC_014910	AGC	2	6	4636289	4636294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319765066
132052	NC_014910	GC	4	8	4636293	4636300	0 %	0 %	50 %	50 %	319765066
132053	NC_014910	CGC	2	6	4636317	4636322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765067
132054	NC_014910	GCGCC	2	10	4636324	4636333	0 %	0 %	40 %	60 %	319765067
132055	NC_014910	GCT	2	6	4636352	4636357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765067
132056	NC_014910	GC	3	6	4636366	4636371	0 %	0 %	50 %	50 %	319765067
132057	NC_014910	CGG	2	6	4636373	4636378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765067
132058	NC_014910	CG	3	6	4636428	4636433	0 %	0 %	50 %	50 %	319765067
132059	NC_014910	CAC	2	6	4636440	4636445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319765067
132060	NC_014910	CGG	2	6	4636478	4636483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765067
132061	NC_014910	CG	3	6	4636524	4636529	0 %	0 %	50 %	50 %	319765067
132062	NC_014910	GC	3	6	4636530	4636535	0 %	0 %	50 %	50 %	319765067
132063	NC_014910	CGG	2	6	4636637	4636642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765067
132064	NC_014910	AGC	2	6	4636746	4636751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132065	NC_014910	GCG	2	6	4636764	4636769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132066	NC_014910	GCG	2	6	4636815	4636820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765068
132067	NC_014910	TGA	2	6	4636826	4636831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319765068
132068	NC_014910	GCC	2	6	4636839	4636844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765068
132069	NC_014910	GTGC	2	8	4636876	4636883	0 %	25 %	50 %	25 %	319765068
132070	NC_014910	GCG	2	6	4636884	4636889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765068
132071	NC_014910	GGTA	2	8	4636904	4636911	25 %	25 %	50 %	0 %	319765068
132072	NC_014910	CGCC	2	8	4636967	4636974	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
132073	NC_014910	GCC	2	6	4636981	4636986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.